Il Museo Domus Tiberiana si trova a nord della Via Tecta ed è organizzato tematicamente in sette sale, quattro delle quali si affacciano sul Foro Romano. Sul lato sud è possibile ammirare le superfici decorate con stucchi dell'epoca di Domiziano, che decorano il cosiddetto Ponte di Caligola; si possono vedere compartimenti decorati con megalografie raffiguranti scene di vita cortese, scoprire i locali di servizio delle terme e delle latrine ed entrare in sale dove è possibile vedere una documentazione di tutti i recenti lavori di ricerca e restauro, insieme alla ricostruzione del palazzo all'interno di una piramide olografica.
La prima sala, sul lato che dà sul Foro Romano, è stata scoperta solo nel 2020 ed è l'unica camera in cui è stata conservata la stratigrafia interna perché sigillata dal crollo della volta. Gli straordinari reperti rinvenuti durante gli scavi getteranno una luce inedita sulla vita nella "città dentro il palazzo" dalla tarda antichità al periodo farnese.
Di particolare interesse è una serie di fasi di abbandono, accompagnate da una vera e propria discarica, risalenti alla fine del V secolo d.C. e all'inizio del Medioevo. Qui sono stati rinvenuti numerosi reperti, tra cui resti di animali, diverse conchiglie di ostriche, anfore (alcune ancora contenenti il loro contenuto originale), ceramiche di uso quotidiano, monete e molti altri oggetti di uso comune. Il restauro della volta ha riportato alla luce l'aspetto spaziale di questo ambiente originale, dove il consumo di beni di pregio che entravano nel palazzo è rappresentato dall'esposizione museale in situ dei reperti rinvenuti durante gli scavi, accompagnati da lampade a olio e monete scoperte negli scavi vicini.
La seconda sala, di modeste dimensioni e poco illuminata, è ideale per esporre i notevoli reperti relativi a un tema antico particolarmente caro al periodo Farnese: il fauno. Il torso è stato rinvenuto tra i depositi, mentre la testa, probabilmente proveniente da un'altra scultura, è stata ottenuta grazie a un sequestro effettuato dall'Unità di Protezione e presenta evidenti segni di alterazioni rinascimentali.
Oltre alle lastre di pietra campane, sono conservati i resti di numerose statue in terracotta, come la famosa statua di Apollo, e repliche di capolavori greci tra il 50 e il 30 a.C., che i visitatori possono toccare.
Questa sala espone i reperti rinvenuti durante gli scavi sotto l'antico palazzo, relativi alla zona residenziale di epoca tardo-repubblicana e augustea. Sono esposti anche elementi architettonici e oggetti domestici provenienti dalle case lungo il fiume Vilabro.
Una sala speciale è dedicata all'Iseo e ai culti misterici legati al palazzo, con reperti provenienti dagli scavi effettuati negli anni '80 nel settore nord-orientale, dove è stata accertata l'esistenza di un sacello dedicato a Iside. Il culto dionisiaco è rappresentato dalle raffinate sculture rinvenute nel criptaportico centrale della Domus Tiberiana. Inoltre, le piccole sculture dei Cauti e dei Cautopates introdurranno i visitatori al culto di Mitra. L'allestimento mira a ricreare l'atmosfera suggestiva di un sacello privato in onore di una divinità misteriosa, utilizzando luci calde e soffuse e un sottofondo sonoro.
Il cuore dell'architettura della Domus Tiberiana è presentato ai visitatori in queste sale, con particolare attenzione alla fase domiziana del palazzo. Viene presentato il laboratorio dello scalpellino, riconosciuto come maestro del Decus e dello Stupor, che conduce a una ricostruzione delle decorazioni architettoniche appartenenti ai diversi periodi di sviluppo di questa domus. Ciò è stato possibile grazie al materiale di studio proveniente sia dai depositi interni che dallo smantellamento dei cumuli di marmo rinvenuti in situ.
L'ultima sezione è dedicata alla statuaria e agli arredi del palazzo, finalmente rappresentati da opere d'arte riportate alla luce negli scavi novecentenari della Domus Tiberiana e di diversi altri palazzi imperiali. Si tratta di pezzi di grande pregio e di accurata fattura, probabilmente opera di scalpellini che potrebbero aver partecipato alla realizzazione degli arredi del palazzo nelle vicinanze o all'interno delle sue mura durante il primo e il medio periodo dell'Impero.
Consiste in un percorso libero e un percorso che attraversa le sale che ospitano i reperti museali.
L'accesso al percorso libero richiede un biglietto standard valido 24 ore per il Colosseo, il Foro Romano e il Palatino. L'accesso al percorso a pagamento richiede anche il pagamento di un biglietto standard valido 24 ore per il Colosseo, il Foro Romano e il Palatino.
Non è previsto alcun costo aggiuntivo per i biglietti Full Experience, i biglietti Forum Pass SUPER e le tessere associative.